Για τα αιγοπρόβατα η απογραφή πραγματοποιείται από 1 Νοεμβρίου έως 15 Δεκεμβρίου και η κοινοποίησή της πρέπει να γίνει εντός 30 ημερών από τη διενέργεια, ενώ για τους χοίρους η απογραφή πραγματοποιείται εντός του Δεκεμβρίου.
Οι κτηνοτρόφοι μπορούν να προσέρχονται στην Κτηνιατρική Υπηρεσία με το Μητρώο Εκμετάλλευσης πλήρως ενημερωμένο (γεννήσεις, θάνατοι, σφαγές, αγοραπωλησίες). Σε περίπτωση που η υποβληθείσα απογραφή χρήζει τροποποίησης λόγω λανθασμένων στοιχείων, ο ενδιαφερόμενος θα πρέπει να απευθύνεται άμεσα στην αρμόδια τοπική κτηνιατρική αρχή. Επίσης, υπάρχει η δυνατότητα ηλεκτρονικής υποβολής, χωρίς επίσκεψη στην υπηρεσία, μέσω της διεύθυνσης http://e-services.minagric.gr.
Τέλος, επισημαίνεται η  διασύνδεση μεταξύ της ψηφιακής υπηρεσίας και ΟΠΣΚ όπως και τη δυνατότητα διάκρισης μεταξύ απογραφών που υποβάλλονται ηλεκτρονικά και αυτών που κοινοποιούνται δια της φυσικής παρουσίας.